شناسایی ژن کد کننده پروتئین pita درقارچ rhizoctonia solani ag1-ia
نویسندگان
چکیده
چکیده- سوختگی غلاف برنج که توسط قارچ rhizoctonia solani ایجاد میشودیکی ازمخرب ترین بیماری های برنج درسرتاسرجهان است. روش متداول مبارزه بااین بیماری استفاده ازقارچ کش هااست که مشکلات جدیدی درپی دارد. بنابراین آشنایی با مکانیسم های سلولی ومولکولی میانکنش ما بین پاتوژن ومیزبان درمدیریت بیماری وبه کارگیری روش های موثر کنترل بیماری ضروری می باشد. دراین تحقیق باا ستفاده ازابزار بیوانفورماتیک وrt-pcr ژن کدکننده پروتئین پیتا(pita)درسه سویه جغرافیایی مختلف، r1, a2 وt2 ازایران، شناسایی شد . توالی های ابتدای ' 5 ازژن پیتا درسویه های موردمطالعه درنواحی اینترونی 100٪ ودرنواحی اگزونی 99٪ تشابه داشتندکه احتمال دخا لت این ژن دربیماری زایی را مطرح می سازد. ازسوی دیگر احتمال ترشحی بودن آن با استفاده از مطالعه بیوانفورماتیک و نرم افزار signalp پیش بینی شد که باتوجه به شباهت زیاد(98٪) آن با ژن پیتادر magnaporthe oryzae احتمال افکتور بودن این ژن در ریزوکتونیا را افزایش می دهد. برای اطمینان از این امر، تعیین توالی کامل ژن ومطالعه بیان آن در میانکنش گیاه- پاتوژن پیشنهاد می شود . کلید واژگان: rhizoctonia solani ، پپتید راهنما، بلاست برنج، افکتور
منابع مشابه
شناسایی ژن کد کننده پروتئین pita درقارچ rhizoctonia solani ag۱-ia
چکیده- سوختگی غلاف برنج که توسط قارچ rhizoctonia solani ایجاد میشودیکی ازمخرب ترین بیماری های برنج درسرتاسرجهان است. روش متداول مبارزه بااین بیماری استفاده ازقارچ کش هااست که مشکلات جدیدی درپی دارد. بنابراین آشنایی با مکانیسم های سلولی ومولکولی میانکنش ما بین پاتوژن ومیزبان درمدیریت بیماری وبه کارگیری روش های موثر کنترل بیماری ضروری می باشد. دراین تحقیق باا ستفاده ازابزار بیوانفورماتیک وrt-pcr ...
متن کاملDevelopment of a Rhizoctonia solani AG1-IB Specific Gene Model Enables Comparative Genome Analyses between Phytopathogenic R. solani AG1-IA, AG1-IB, AG3 and AG8 Isolates
Rhizoctonia solani, a soil-born plant pathogenic basidiomycetous fungus, affects various economically important agricultural and horticultural crops. The draft genome sequence for the R. solani AG1-IB isolate 7/3/14 as well as a corresponding transcriptome dataset (Expressed Sequence Tags--ESTs) were established previously. Development of a specific R. solani AG1-IB gene model based on GMAP tra...
متن کاملRSIADB, a collective resource for genome and transcriptome analyses in Rhizoctonia solani AG1 IA
Rice [Oryza sativa (L.)] feeds more than half of the world's population. Rhizoctonia solaniis a major fungal pathogen of rice causing extreme crop losses in all rice-growing regions of the world. R. solani AG1 IA is a major cause of sheath blight in rice. In this study, we constructed a comprehensive and user-friendly web-based database, RSIADB, to analyse its draft genome and transcriptome. Th...
متن کاملDe novo Transcriptome Analysis of Rhizoctonia solani AG1 IA Strain Early Invasion in Zoysia japonica Root
Zoysia japonica brown spot was caused by necrotrophic fungus Rhizoctonia solani invasion, which led to severe financial loss in city lawn and golf ground maintenance. However, little was known about the molecular mechanism of R. solani pathogenicity in Z. japonica. In this study we examined early stage interaction between R. solani AG1 IA strain and Z. japonica cultivar "Zenith" root by cell ul...
متن کاملThe transcriptional landscape of Rhizoctonia solani AG1-IA during infection of soybean as defined by RNA-seq
Rhizoctonia solani Kühn infects most plant families and can cause significant agricultural yield losses worldwide; however, plant resistance to this disease is rare and short-lived, and therefore poorly understood, resulting in the use of chemical pesticides for its control. Understanding the functional responses of this pathogen during host infection can help elucidate the molecular mechanisms...
متن کاملComparative Transcriptome Analyses of Gene Expression Changes Triggered by Rhizoctonia solani AG1 IA Infection in Resistant and Susceptible Rice Varieties
Rice sheath blight, caused by Rhizoctonia solani, is one of the most devastating diseases for stable rice production in most rice-growing regions of the world. Currently, studies of the molecular mechanism of rice sheath blight resistance are scarce. Here, we used an RNA-seq approach to analyze the gene expression changes induced by the AG1 IA strain of R. solani in rice at 12, 24, 36, 48, and ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
زیست فناوری دانشگاه تربیت مدرسناشر: دانشگاه تربیت مدرس
ISSN
دوره 4
شماره 2 2013
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023